常用的計數方法主要有手工計數(如利用改良牛鮑計數板)和細胞計數儀計數(經(jīng)費充裕組常備)。從原理來(lái)說(shuō)，這兩種方法基本類(lèi)似，大致是通過(guò)臺盼蘭或者熒光染料染色后，用肉眼或者用攝像機拍照后進(jìn)行計數，差別就是前者人累，且精準度和穩定性較差；后者不累人，且精準度和穩定性較好。

　　單細胞測序實(shí)驗的第一步是單細胞懸液的制備，而懸液制備中細胞計數的準確性直接影響單細胞測序的數據質(zhì)量。

　　1.  計數板

　　用96%酒精沖洗計數板后，用干凈鹿皮擦凈，另擦凈蓋片一張；把蓋片覆在計數板上面，使之微微移向一側，露出計數板臺面少許，以便滴加細胞懸液；

　　2.  染色

　　取吸管1 支，伸入培養瓶中，輕輕反復吹打細胞懸液使細胞重懸均勻后，立即吸細胞懸液少許，向另一離心管中滴入細胞懸液9 滴，再滴入臺盼藍染液1 滴，混勻，置2~3 分種；

　　3.  加懸液

　　把計數板平放在顯微鏡臺上，立即從計數板邊緣輕輕滴1~2 滴已染色的細胞懸液，使之充滿(mǎn)計數板和蓋片間空隙中；

　　4.  鏡檢

　　鏡下觀(guān)察可見(jiàn)細胞分散各處，健康細胞胞體完整，透明不著(zhù)色，凡著(zhù)色細胞均為不健康者。計算四角大方格內的細胞數；壓中線(xiàn)者只計算左線(xiàn)和上線(xiàn)者，右線(xiàn)和下線(xiàn)不計算在內(即僅計算壓兩個(gè)邊的細胞)。

　　5.  接種培養

　　通過(guò)計數測知懸液中細胞數后，可根據實(shí)驗所需細胞數量向培養容器中接種。細胞接種數量隨實(shí)驗目的、血清含量和細胞生物性狀而定；一般接種量在1~10x105細胞/毫升范圍，實(shí)驗周期短，希望細胞增殖較快時(shí)，接種量可大些。用含血清量大的培養液培養胚胎來(lái)源細胞、無(wú)限細胞系和惡性細胞系時(shí)，細胞接種數量不宜太大。