RNA 測序 (RNA-seq) 是一項革命性技術(shù)，改變了基因組學(xué)領(lǐng)域。它為研究人員揭示細(xì)胞和分子水平上發(fā)生的許多復(fù)雜過程開辟了新途徑。與 DNA 測序不同，RNA-seq 通過提供任何給定時間所有活性基因的快照來深入了解基因組的功能元件。那么，這如何幫助用戶對不同的細(xì)胞類型進(jìn)行分類呢？請繼續(xù)閱讀以了解更多信息。

RNA 測序在細(xì)胞類型分類中的威力

RNA 測序已成為細(xì)胞類型分類的強大工具。它使科學(xué)家能夠識別特定的細(xì)胞類型并了解它們在各種生物過程中的作用。這是因為 RNA-seq 能夠分析單個細(xì)胞中的基因表達(dá)水平。許多研究領(lǐng)域都將從這種開創(chuàng)性的方法中受益，但它在研究肺纖維化等疾病方面已經(jīng)顯示出非凡的潛力，在這些疾病中，不同細(xì)胞群的作用尚未全了解。

單細(xì)胞 RNA 測序：游戲規(guī)則改變者

單細(xì)胞 RNA 測序 (scRNA-seq) 將 RNA 測序提升到一個新水平。它使科學(xué)家能夠分析單個細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組，提供細(xì)胞類型和狀態(tài)的高分辨率視圖。與傳統(tǒng)的 RNA 測序方法相比，這是一個重大進(jìn)步，傳統(tǒng)的 RNA 測序方法提供大量細(xì)胞的平均基因表達(dá)譜。

在最近一項題為“單細(xì)胞 RNA 測序揭示肺纖維化中不同上皮和間質(zhì)譜系的促纖維化作用"的研究中，scRNA-seq 被用來揭示肺纖維化的復(fù)雜細(xì)胞景觀。該研究使用 10x Genomics Chromium 平臺進(jìn)行單細(xì)胞 RNA 測序，該平臺生成乳液中的單細(xì)胞凝膠珠 (GEM)，用于逆轉(zhuǎn)錄過程以創(chuàng)建 cDNA。然后對該 cDNA 進(jìn)行擴增并用于測序。

DeNovix 在 RNA 測序中的作用

DeNovix DS-11 FX+ 分光光度計/熒光計在這項研究中發(fā)揮了至關(guān)重要的作用。該儀器用于定量 RNA，這是 RNA 測序過程中的關(guān)鍵步驟。RNA的定量確保了測序過程有足夠的材料，并有助于保證樣品的質(zhì)量。這是 10x Genomics 平臺單細(xì)胞 RNA 測序的準(zhǔn)備步驟。

細(xì)胞計數(shù)是 RNA 測序的另一個重要準(zhǔn)備步驟。在一項相關(guān)研究“模擬人類肺細(xì)胞暴露于野火中發(fā)現(xiàn)異常的 lncRNA 特征"中，DeNovix CellDrop™ 系統(tǒng)用于在 0.4% 臺盼藍(lán) 1:1 稀釋液中對人類永生化支氣管氣管細(xì)胞 (AALE) 進(jìn)行計數(shù)，并在其死亡前 24 小時進(jìn)行計數(shù)。直接煙霧暴露（DSE）。暴露于氣液界面 (ALI) 室后，細(xì)胞用于 RNA 測序分析，以識別 IncRNA 的變化。結(jié)果表明煙霧成分對于野火煙霧的分子效應(yīng)的重要性。具體來說： 

“我們的結(jié)果闡明了化學(xué)成分（以及地理來源）在評估野火煙霧暴露可能導(dǎo)致的呼吸系統(tǒng)健康風(fēng)險方面的重要性。我們使用通過實驗生成的 RNA-seq 數(shù)據(jù)進(jìn)行公正的分析，旨在識別差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本，在這里，通過嚴(yán)格和全局的分析，我們證明不同的野火煙霧會誘導(dǎo) lncRNA 的異常表達(dá)。"

機器學(xué)習(xí)和 RNA 測序

機器學(xué)習(xí)是另一種越來越多地與 RNA 測序結(jié)合使用的工具。通過訓(xùn)練已知細(xì)胞類型的數(shù)據(jù)，機器學(xué)習(xí)算法可以根據(jù)細(xì)胞類型的基因表達(dá)譜對細(xì)胞類型進(jìn)行分類。這可以大大提高細(xì)胞類型分類的準(zhǔn)確性和效率。

RNA測序的應(yīng)用

RNA-seq 的應(yīng)用廣泛且多樣。從了解疾病中細(xì)胞群的復(fù)雜性到發(fā)現(xiàn)選擇性剪接變體，RNA-seq 是現(xiàn)代基因組學(xué)庫中的多功能工具。

RNA 測序的未來

隨著新技術(shù)和方法的不斷開發(fā)，RNA測序的未來是光明的。對不同 RNA 分子及其表達(dá)水平的研究不斷增長，這將與 RNA-seq 的進(jìn)步契合，并擴大我們可以理解的細(xì)胞類型的數(shù)量。 

在 DeNovix，我們很自豪能夠成為這個令人興奮的領(lǐng)域的一部分。我們邀請您探索我們的產(chǎn)品和服務(wù)范圍，并與我們一起突破 RNA 測序的可能界限。使用我們的組合分光光度計/熒光計和開創(chuàng)性的自動細(xì)胞計數(shù)器，用戶可以優(yōu)化 RNA 測序的準(zhǔn)備步驟，以保證最高的質(zhì)量。我們可以一起繼續(xù)解開細(xì)胞的秘密，并在分子水平上增進(jìn)我們對生命的理解。