要成功地執行 Duolink® PLA 實(shí)驗,實(shí)驗方案中有一些必要的考慮因素需要正確地準備、設置和執行。Duolink® PLA 產(chǎn)品可用于熒光和明場(chǎng)。熒光 Duolink® PLA 試劑可用于顯微鏡和流式細胞術(shù)應用。
一、實(shí)驗設計
要設計一個(gè)成功的Duolink® PLA實(shí)驗,必須考慮很多因素。這些因素包括但不限于:
1.確定蛋白質(zhì)靶標和實(shí)驗類(lèi)型
2.選擇樣品(細胞或組織)
3.設計您的讀出方案
4.設計實(shí)驗對照(技術(shù)和生物)
靶標識別:
首先要確定的是目標蛋白靶標。是單一蛋白質(zhì)表達,蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用 (PPI),還是蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTM)?下面簡(jiǎn)要介紹了 Duolink® PLA 如何用于檢測各種類(lèi)型的蛋白靶點(diǎn)。
單一蛋白表達的檢測:
檢測單個(gè)蛋白靶標有兩種方法,即使用針對靶標的一種一抗進(jìn)行單一識別或兩種一抗進(jìn)行雙重識別。
單一識別:
具有最高的靈敏度,建議在檢測低表達水平的單一蛋白質(zhì)靶標時(shí)使用。也可用于雙重識別實(shí)驗前對單個(gè)一抗濃度的測定。但是,只有當性能良好的特異性一抗可用時(shí),才推薦使用此方法。由于測定的敏感性,使用非特異性一抗將導致高背景。
雙重識別:
通過(guò)使用兩種一抗提供了更高的特異性。每種一抗必須針對同一靶分子上不同的、非競爭性的表位。而且,這兩種一抗必須在不同物種(小鼠、兔或山羊)中培養,并且必須在相同的實(shí)驗條件下與靶標結合。這些條件在下面的實(shí)驗準備部分中進(jìn)行了描述。
蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)的相互作用檢測:
Duolink® PLA是檢測蛋白質(zhì)相互作用的方法。該方法使用兩種一抗來(lái)完成,每種抗體針對一種目標靶標,且在不同物種(小鼠、兔或山羊)中培養。兩種一抗必須在相同的實(shí)驗條件下與靶標結合。
蛋白質(zhì)與核酸的相互作用檢測:
蛋白質(zhì)-DNA 和蛋白質(zhì)-RNA 相互作用也可以通過(guò)使用修飾的原位雜交技術(shù)結合Duolink® PLA來(lái)進(jìn)行檢測。
二、實(shí)驗準備
為確保成功執行 Duolink® PLA 實(shí)驗,需要進(jìn)行大量準備工作。這些準備工作與傳統的 IF、IHC 或流式細胞術(shù)所需的工作類(lèi)似。本節描述了一抗鑒定、樣品制備和抗體優(yōu)化的注意事項。
一抗的選擇:
Duolink® PLA試劑是使用二抗進(jìn)行靶標特異性一抗檢測的通用試劑。設置 Duolink® PLA 實(shí)驗時(shí),一抗的選擇至關(guān)重要。
要求:
Duolink® PLA探針是驢抗小鼠、抗兔或抗山羊二抗;因此,對一抗有特定要求。這包括:
1.IgG 類(lèi)
2.可以是單克隆或多克隆
3.優(yōu)選親和純化以使交叉反應性最小化
4.建議使用 IF 或 IHC 驗證
5.宿主必須是小鼠、兔子或山羊(特例情況要求使用Duolink® Probemaker)
直接偶聯(lián)一抗的使用:
有些情況下需要使用直接偶聯(lián)的一抗。Duolink® Probemaker能夠將 PLA oligo (PLUS 或 MINUS) 偶聯(lián)到任何抗體上。使用 Duolink® Probemaker 的注意事項如下:
1.當一抗的宿主不是小鼠、兔或山羊時(shí)
2.當使用來(lái)自同一物種的兩種一抗時(shí)
3.當使用在與組織樣品相同的宿主中產(chǎn)生的一抗時(shí)(例如,“小鼠一抗檢測小鼠樣品")
一抗優(yōu)化:
為了成功執行 Duolink® PLA 實(shí)驗,確定待測樣品中最佳一抗性能的條件非常重要。一抗優(yōu)化的條件應包括:
1.樣品處理(固定、透化和抗原修復)
2.一抗濃度
3.阻斷溶液和抗體稀釋劑
下面介紹樣品處理、阻斷和抗體稀釋劑的具體注意事項。強烈建議首先通過(guò) IF 或 IHC 染色鑒定一抗的條件。當使用兩種一抗時(shí),每種一抗的優(yōu)化應分開(kāi)進(jìn)行,但樣品處理需要兼容兩種一抗的最佳性能。
一旦 通過(guò)IF 或 IHC 確定了條件,這些條件就可以應用于 Duolink® PLA。但是,Duolink® PLA 實(shí)驗可能需要進(jìn)一步滴定一抗濃度,因為與 IF 和 IHC 相比,Duolink® PLA 具有更高的靈敏度和更放大的信號。使用上述Duolink® PLA單一識別方法可在優(yōu)化一抗濃度時(shí)提供最高的靈敏度。這些條件可用于使用兩種一抗的 Duolink® PLA 實(shí)驗。
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