蛋白質(zhì)是多肽分子(或由多個(gè)多肽亞單位組成)。區別在于肽是短的，多肽蛋白質(zhì)是長(cháng)的。確定這些有幾種不同的約定，都有瑕疵。

一個(gè)慣例是，那些足夠短的肽鏈被稱(chēng)為肽，而不是蛋白質(zhì)，這些肽鏈可以由氨基酸合成。然而，隨著(zhù)更好的合成技術(shù)的出現，可以制造長(cháng)達數百個(gè)氨基酸的肽，包括像泛素這樣的完整蛋白質(zhì)。天然的化學(xué)連接可以獲得更長(cháng)的蛋白質(zhì)，所以這種慣例似乎過(guò)時(shí)了。

另一個(gè)慣例是在大約50個(gè)氨基酸的長(cháng)度處放置一個(gè)非正式的分界線(xiàn)(一些人聲稱(chēng)長(cháng)度更短)。然而，這個(gè)定義有些武斷。長(cháng)肽，如與阿爾茨海默病相連的淀粉樣β肽，可以被認為是蛋白質(zhì)；小蛋白質(zhì)，如胰島素，可以被認為是肽。由于這一定義的隨意性，在科學(xué)界有相當多的人傾向于使用更具體的定義，即“肽是沒(méi)有二級結構的氨基酸分子；一旦獲得確定的結構，它就是蛋白質(zhì)。"因此，根據環(huán)境的不同，同一分子既可以是肽也可以是蛋白質(zhì)，盡管有些肽不能是蛋白質(zhì)。

1.肽類(lèi)別

根據肽的產(chǎn)生方式，肽主要分為以下幾類(lèi):

1.1.核糖體肽

核糖體肽是通過(guò)翻譯mRNA合成的。它們通常經(jīng)過(guò)蛋白水解產(chǎn)生成熟形式。這些功能，通常在高等生物中，作為激素和信號分子。一些低等生物產(chǎn)生作為抗生素的肽，例如microcin J25。因為它們是翻譯的，所以涉及的氨基酸殘基僅限于核糖體利用的那些殘基，及其翻譯后修飾，如磷酸化、羥基化、磺化、二硫鍵形成等。一般來(lái)說(shuō)，它們是線(xiàn)性的，雖然套索結構是常見(jiàn)的。然而，更奇特的操作確實(shí)發(fā)生了，例如外消旋化(如在鴨嘴獸毒液中)或使用非核糖肽模塊(見(jiàn)下文)(如在比司他胺a中)。

1.2.非核糖體肽

非核糖體肽是使用模塊化酶復合物(其功能很像工廠(chǎng)中的傳送帶)合成的。非核糖體肽主要局限于單細胞生物、植物和真菌。所有這些復合體都以相似的方式布局，并且它們可以包含許多不同的模塊來(lái)對開(kāi)發(fā)中的產(chǎn)品執行各種各樣的化學(xué)操作。一般來(lái)說(shuō)，這些肽是環(huán)狀的(通常具有高度復雜的環(huán)狀結構)，盡管線(xiàn)性非核糖體肽是常見(jiàn)的。由于該系統是模塊化的，并且與構建脂肪酸和聚酮化合物的機制密切相關(guān)，因此經(jīng)常發(fā)現雜化化合物。噁唑、噻唑和它們的還原對應物通常表明該化合物是以這種方式合成的。

1.3.胨類(lèi)

蛋白胨來(lái)源于蛋白酶消化的動(dòng)物肉。所得材料用作生長(cháng)細菌和真菌的營(yíng)養培養基中的蛋白質(zhì)來(lái)源。

1.4.肽片段

指用于鑒定或定量來(lái)源蛋白質(zhì)的蛋白質(zhì)片段。這些通常是在實(shí)驗室對受控樣品進(jìn)行酶降解的產(chǎn)物，但也可能是因自然作用而降解的法醫或古生物學(xué)樣品。

2.分子生物學(xué)中的肽

近來(lái)，由于幾個(gè)原因，肽在分子生物學(xué)中受到了重視。首先也是最重要的是，肽允許在動(dòng)物體內產(chǎn)生抗體，而不需要純化感興趣的蛋白質(zhì)。人們可以簡(jiǎn)單地制備感興趣的蛋白質(zhì)部分的抗原性肽。這些將足以在兔子或老鼠體內產(chǎn)生針對這種蛋白質(zhì)的抗體。

另一個(gè)原因是肽已經(jīng)成為質(zhì)譜分析的工具，允許根據肽質(zhì)量和序列鑒定感興趣的蛋白質(zhì)。

肽最近被用于蛋白質(zhì)[結構]和功能的研究。例如，合成肽可以用作探針來(lái)觀(guān)察蛋白質(zhì)-肽相互作用發(fā)生的位置。

抑制肽也用于臨床研究，以檢查肽對癌蛋白和其他疾病的抑制作用。

3.肽家族

本節中的肽家族都是核糖體肽，通常具有激素活性。所有這些肽都由細胞合成為較長(cháng)的“前肽"或“前蛋白"，并在離開(kāi)細胞前被截短。它們被釋放到血液中，并在其中發(fā)揮其信號功能。

3.1.速激肽肽

• p物質(zhì)
• 卡西寧
• 神經(jīng)激肽A
• 欖香烯
• 神經(jīng)激肽B

3.2.血管活性腸肽

• VIP血管活性腸肽
• 垂體腺苷酸環(huán)化酶激活肽
• PHI 27
• PHM 27
• 生長(cháng)激素釋放激素
• 胰高血糖素
• 分泌素

3.3.胰多肽相關(guān)肽

• 神經(jīng)肽y
• PYY肽YY
• APP禽胰多肽
• HPP人胰多肽

3.4.降鈣素肽

• 降血鈣素
• 胰淀素
• AGG01